Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms