Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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