Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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