Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Rnf4Q9QZS2 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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