Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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