Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Usp29Q9ES63 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms