Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms