Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Cldn22Q9D7U6 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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