Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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