Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms