Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms