Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Fam20bQ8VCS3 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms