Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms