Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms