Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms