Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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