Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms