Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms