Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms