Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Ttc39dQ0VF76 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ttc39dQ0VF76 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms