Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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VdrP48281 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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VdrP48281 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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