Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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