Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms