Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
ScaperF8VQ70 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms