Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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