Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rrn3B2RS91 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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