Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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