Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf4Q9QZS2 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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