Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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