Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms