Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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