Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms