Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NsmfQ99NF2 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NsmfQ99NF2 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NsmfQ99NF2 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
NsmfQ99NF2 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
NsmfQ99NF2 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms