Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms