Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Atg4aQ8C9S8 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Atg4aQ8C9S8 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Atg4aQ8C9S8 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Atg4aQ8C9S8 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Atg4aQ8C9S8 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Atg4aQ8C9S8 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Atg4aQ8C9S8 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Atg4aQ8C9S8 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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