Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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