Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms