Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms