Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tmf1B9EKI3 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tmf1B9EKI3 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tmf1B9EKI3 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tmf1B9EKI3 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tmf1B9EKI3 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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