Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms