Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Smg9Q9DB90 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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