Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms