Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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