Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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