Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprtQ99M80 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms