Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp16Q99LG0 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp16Q99LG0 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms