Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms