Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ubxn4Q8VCH8 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms