Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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NischQ80TM9 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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NischQ80TM9 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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NischQ80TM9 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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NischQ80TM9 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NischQ80TM9 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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