Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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NipblQ6KCD5 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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NipblQ6KCD5 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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NipblQ6KCD5 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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NipblQ6KCD5 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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NipblQ6KCD5 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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